Por mando de el-rei D. Sebastião e antiga devoção dos portugueses, à entrada principal de cada povoação deveria edificar-se uma igreja em honra de S. Sebastião. A ermida de S. Sebastião de Monchique, a sul da vila será um exemplo deste decreto, tanto mais que há pouco se descobriu que aquele monarca visitou esta terra em 1573 quando pela primeira vez veio ao Algarve.

De exterior modesto, guarda uma imagem impregnada de tristeza de Nossa Senhora do Desterro, boa obra de escultura do séc. XVII, proveniente do antigo convento fraciscano. Possivelmente tem a mesma origem o baldaquino e as colunas fantasiosas que integram o retábulo do altar.